עלות הקמת גג סולארי היא נושא חשוב שיש לקחת בחשבון כאשר שוקלים השקעה בטכנולוגיה ירוקה. הקמה של גג סולארי יכולה להיות השקעה משתלמת לטווח ארוך, אך ישנם גורמים רבים שמשפיעים על העלות הסופית.
ראשית, העלות של המערכת הסולארית עצמה משתנה בהתאם לגודל המערכת הנדרשת, איכות הפאנלים הסולאריים והטכנולוגיה הנבחרת. מערכת קטנה המיועדת לבית פרטי יכולה לעלות בין 40,000 ל-70,000 ש"ח, בעוד שמערכות גדולות יותר המיועדות למבנים מסחריים עשויות לעלות הרבה יותר. יש לקחת בחשבון גם את עלויות ההתקנה, שיכולות להוסיף בין 10% ל-25% למחיר הכולל של המערכת.
גורם נוסף שיכול להשפיע על עלות הקמת גג סולארי הוא המיקום הגיאוגרפי. באזורים עם שמש רבה, המערכת תוכל לייצר יותר אנרגיה, מה שיכול להפחית את זמן ההחזרה